همین امر سبب شد تا شایعات زیادی راجع به نقش درگیری های کی روش و برانکو ایوانکوویچ (سرمربی وقت پرسپولیس) در خط خوردن سیدجلال مطرح شود که همواره از سوی سرمربی پرتغالی تیم ملی تکذیب شد.
با این حال حمیدرضا گرشاسبی مدیرعامل پیشین پرسپولیس پس از صعود این تیم به نیمه نهایی لیگ قهرمانان ۲۰۱۸ آسیا مدعی بود گل سیدجلال حسینی در بازی پرسپولیس با الجزیره امارات در لیگ قهرمانان آسیا باعث خط خوردن این بازیکن از تیم ملی شده است.
کاپیتان سرخپوشان پایتخت نیز هرگز این موضوع را تایید نکرد. حسینی حالا پیگیر پاداش ۲۰ هزار دلاری بازیکنانی است که در صعود تیم ملی به جام جهانی ۲۰۱۸ روسیه نقش داشتند. این مبلغ هنوز از سوی فدراسیون به حسینی داده نشده و در این باره شفاف سازی لازم نیز صورت نگرفته است.